Первый способ. Сделайте тестовый файл для простоты, например, четыре точки по углам или прямоугольник с заданными размерами. Введите в программе перед загрузкой размеры платы. Загрузите и выполните задание. Измерьте полученные в результате размеры. Поделите размер, который должен получиться, на тот, который реально получился, получите коэффициент. Пересчитайте размер задания для программы используя коэффициент, и введите полученные размеры, загрузите файл и выполните задание, проверьте размеры. Если размеры совпали, то используйте этот коэффициент.
Второй способ. По аналогичной методике рассчитайте и введите в контроллер значение постоянных $100, $101 и $102.
http://instrumentotvet.ru/grbl-0-9j-perevod/