Попробуйте тогда "по воздуху" прогнать УП-шку, найдя рабочий ноль(любую другую точку) касаниями фрезой по углу заготовки или чего-нибудь закреплённому на столе(ну или любым другим удобным методом), а после прогона УП проверить этот ноль ещё раз тем же методом, посмотреть координаты.
У Мака ещё есть странная фича с "оптимизацией" кода на постоянную скорость подачи, я не знаю распространяется ли она на холостые переходы  
viewtopic.php?p=622406#p622406 , в доках там у них раздел есть  Path Control Modes по этому вопросу.