Вы этот станок для чего приобретали? Что производить?
Лично я бы убедился, что все плавно перемещается, рейка не упирается в шестерню, каретки не разжимает и т.д. Это самое главное.
Потом выставил бы количество шагов на мм на все рабочее поле, по какой нибудь рулетке 1го класса, ну или второго. Гравером натыкал шкалу по 50 мм и проверил, что +- попадает, т.е. рейка установлена более менее. Потом поставил бы точки по углам рабочего стола и постарался бы уровнять диагонали.
Ну и шпиндель бы перпендикулярно столу поставил.
Это станок с очень условной точностью. Можно подобный станок настроить выставить идеально, но результат он все равно не выдаст такой же) Из-за конструкционных особенностей. Поэтому можно и особо не стараться.