Не вижу смысла заострять внимание на диске. Поменять диск дело не долгое. А вот собрать все все грамотно это намного сложнее. Со всей автоматикой, реле куча, продумать алгоритмы. А диск... ну пару часов очень не спеша.
Вентиляция принудительная, конечно будет. По превышению температуры. Думаю 30 градусов будет то что надо. Чтобы в сырость сам себя грел. Там снизу и сверху есть специальные вырубки под ветиляторную планку. Думаю снизу нагнетать, чтобы сверху не летел мусор.
Кстати прикол. Собирал себе супер комп, нужны были 4шт 140 мм тихих вентилятора с ШИМ - на вопрос в магазинах есть вентиляторы - продавцы просто теряли дар речи. У них это КУЛЕР называется.
И так высокомерно - вентилятор это на полу который в квартире
По поводу Linux.
Я пользуюсь время от времени. Есть такая сборка BT5.
Поставил на один из дисков, работает все.
Все понятно но не привычно.
Поэтому я не стал затеваться с ЛинухСНС. Много читать и изучать нужно. Все не охватить.